京都大学化学研究所研究者情報   [ English | Japanese ]


森 智弥(もり ともや)

バイオインフォマティクスセンター 数理生物情報
(情報学研究科 知能情報学専攻 協力講座 協力講座)
助教
博士(情報学)
URL:
E-mail: tmori at kuicr.kyoto-u.ac.jp
Tel: 0774-38-3016
Fax: 0774-38-3022

研究・教育歴
    2015.9 京都大学大学院 情報学研究科 知能情報学専攻 博士後期課程修了
    2015.9 京都大学情報学博士
    2015.10 京都大学化学研究所 日本学術振興会特別研究員(PD)
    2015.11 京都大学iPS細胞研究所 日本学術振興会特別研究(PD)
    2016.4 京都大学iPS細胞研究所 特定研究員
    2018.4 京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター 助教
専門分野
    バイオインフォマティクス
主な研究テーマ
  1. グラフ構造データの比較アルゴリズム開発
  2. ブーリアンネットワークによるシグナル伝達ネットワークのモデル化とシミュレーション
  3. 単一細胞トランスクリプトーム/メチローム解析
主な論文・著書
  1. Liu L, Mori T, Zhao Y, Hayashida M, Akutsu T, Euler string-based compression of tree-structured data and its application to analysis of RNAs Current Bioinformatics 13(1), 25-33 (2018)
  2. Mori T, Yamane J, Kobayashi K, Taniyama N, Tano T, Fujibuchi W, Development of 3D tissue reconstruction method from single-cell RNA-seq data Genomics and Computational Biology 3(1), e53 (2017)
  3. Yamane J, Mori T, Taniyama N, Kobayashi K, Fujibuchi W, Development of enhanced reduced representation bisulfite sequencing method for single-cell methylome analysis Genomics and Computational Biology 3(2), e49 (2017)
  4. Kato Y, Mori T, Sato K, Maegawa S, Hosokawa H, Akutsu T, An accessibility-incorporated method for accurate prediction of RNA-RNA interactions from sequence data Bioinformatics 33(2), 201-209 (2017)
  5. Cheng X, Mori T, Qiu Y, Ching W-K, Akutsu T, Exact identification of the structure of a probabilistic Boolean network from sample IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 13(5), 1107-1116 (2016)
  6. Hasegawa T, Niida A, Mori T, Shimamura T, Yamaguchi R, Miyano S, Akutsu T, Imoto S, A likelihood-free filtering method via approximate Bayesian computation in evaluating biologival simulation models Computational Statistics and Data Analysis 94, 63-74 (2016)
  7. Mori T, Takasu A, Jansson J, Hwang J, Tamura T, Akutsu T, Similar subtree search using extended tree inclusion IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering 27(12), 3360-3373 (2015)
  8. Mori T, Flöttmann M, Krantz M, Akutsu T, Klipp E , Stochastic simulation of Boolean rxncon model: towards quantitative analysis of large signaling networks BMC Systems biology 9(45), 9 pages (2015)
  9. Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T, Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks BMC Systems biology 9(14), 13 pages (2015)
  10. Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi T, Imoto S, Miyano S, Akutsu T, An efficient data assimilation schema for restoration and extension of gene regulatory networks using time-course observation data Journal of Computational Biology 21(11), 785-798 (2014)
  11. Mori T, Tamura T, Fukagawa D, Takasu A, Tomita E, Akutsu T, A clique-based method using dynamic programming for computing edit distance between unordered trees Journal of Computational Biology 19(10), 1089-1104 (2012)


Update: Apr 03,2018